氢气使用的方法主要包括呼吸氢气、饮用氢水和注射氢气盐水溶液，这些方法都属于补充体内氢气的途径，也都有相关的研究证据支持，对多种疾病具有潜在的治疗价值。在这些方法中，饮用和注射都是通过水作为载体吸收，存在类似性，呼吸氢气是通过肺吸收，有不同特点。

呼吸氢气和饮用氢水最大的区别是吸收途径不一样，一个是通过呼吸系统，一个是通过消化系统，对呼吸摄取氢气一般没有人有异议，但通过消化道吸收氢气有一些人提出质疑，其实通过消化道吸收氢气没有任何问题，理论上消化道吸收溶解在水中的气体没有障碍，也有研究证据证明饮用氢水后可以从呼吸气体中检测出氢气。

其次是呼吸氢气可以获得比较高的氢气剂量。氢气的溶解度限制，通过饮用有剂量限制，如果氢气浓度只在2%左右，呼吸时间在30分钟左右，剂量上和饮用饱和氢水类似，达到血液中氢气的浓度和总量都差别不大。但是呼吸氢气的浓度可以高于2%，甚至可达到几十倍的浓度，呼吸时间也可以进一步延长，这种情况下，氢气被吸收的量可远远超过饮用氢水的量。理论上，氢气进入人体数量越多，产生的效应越明显，因此呼吸高浓度氢气效果可能比饮用氢水更好。不过现在并没有研究证据比较呼吸高浓度氢气和饮用氢水之间的差别，因此并不能明确这种差异。可能的情况是，不同个体和不同疾病之间可能存在差异。由于呼吸氢气能获得更高的氢气剂量，一般来说作为疾病治疗有更大的潜力和空间。

呼吸氢气和饮用氢水似乎存在目标疾病上的差异。从初步使用经验上看，饮用氢气对消化道疾病的效果比较理想，呼吸氢气对呼吸系统疾病有更强针对性。例如饮用氢水对许多便秘患者效果非常好，但呼吸氢气没有这样的效果。对睡眠改善方面，呼吸氢气的效果似乎比氢水更明显。这些研究目前仍然缺乏明确的研究证据，需要进一步深入研究探讨。

也有一些研究认为，持续性补充氢气不如间歇性补充氢气的效果，如通过消化道细菌持续产生氢气就不如饮用氢水这种间隔补充氢气的效果更理想。持续不断呼吸氢气可能效果不理想，间隔呼吸氢气可能会提高效果。

由于氢气呼吸不仅可以更多吸收氢气，而且不受饮水量的限制，以治疗疾病为目的可以呼吸氢气，以促进健康，作为一种健康生活方式，可以饮用氢水。氢气作为一种非常安全的工具，只要有效果就非常值得使用，呼吸饮用等多种方法联合使用也可以尝试。

总之，呼吸能提供比较高的剂量，适合治疗，饮用氢水更方便日常使用保健，但关于氢气的给予方式差异，或者氢气的剂量效应关系，目前并没有比较确定的结论，尚需要进一步系统研究。